税理士法人プライムパートナーズ

相続で事業を引き継いだ場合の納税義務について徹底解説(消費税)

2025-08-26
目次

身近な方が亡くなり、個人事業を引き継ぐことになったとき、「消費税は納める必要があるのかな?」と不安になる方も多いのではないでしょうか。普段の確定申告とは違い、事業を引き継いだ年の消費税の計算には特別なルールが用意されています。ここでは、消費税の納税義務がいつから発生するのか、基準となる売上高の考え方や、インボイス制度の手続きなどについて、具体的な金額を交えながら分かりやすく解説していきます。

消費税の納税義務の基本的な判定ルール

消費税を納める必要があるかどうかは、毎年しっかりと確認する必要があります。まずは、原則的なルールと、相続が起きた場合の特別なルールについて見ていきましょう。

原則は基準期間の売上高1,000万円で判定

個人事業主が消費税を納める義務があるかどうかは、原則として基準期間(前々年)の課税売上高が1,000万円を超えるかどうかで判定します。たとえば、今年の納税義務を確認したい場合、2年前の1月1日から12月31日までの売上高を振り返ります。このときの売上高が1,000万円を超えていれば、今年は消費税を納める課税事業者となり、1,000万円以下であれば消費税の納付が免除される免税事業者となります。

個人事業主が事業を相続した際の特例

ご自身が免税事業者であっても、相続によって事業を引き継いだ場合は注意が必要です。引き継いだ事業の規模によっては、すぐに消費税を納めなければならないことがあります。この場合、ご自身の売上高だけでなく、亡くなった方(被相続人)の過去の売上高も考慮して判定するという特別なルールが適用されます。そのため、「自分は売上が少ないから免税だ」と思い込んでしまうと、後から消費税の申告漏れを指摘されるおそれがあります。

相続があった年の消費税の納税義務について

事業を引き継いだその年(相続があった年)については、通常とは異なる基準で判定を行います。具体的な判定の仕組みと計算の例を見てみましょう。

被相続人の売上実績のみで判定します

相続があった年の消費税の納税義務は、被相続人の基準期間(前々年)における課税売上高が1,000万円を超えるかどうかだけで判定します。もし1,000万円を超えている場合は、相続が発生した日の翌日から、その年の12月31日までの期間について、消費税を納める義務が発生します。このとき、事業を引き継いだ相続人ご自身の売上高は計算に含めません。

相続開始の年から課税事業者になる具体例

実際にどのようなスケジュールで課税事業者になるのか、具体的な例と表で確認してみましょう。亡くなった方の2年前の売上高が1,500万円だった場合を想定します。

項目 具体的な内容
相続が発生した日 令和7年5月10日
被相続人の2年前の課税売上高 1,500万円
消費税を納める期間 令和7年5月11日~令和7年12月31日

このように、被相続人の前々年の売上高が1,000万円を超えているため、相続人は相続日の翌日である5月11日から年末までの間、消費税の課税事業者として扱われます。年の途中から切り替わる点に注意してください。

相続の翌年または翌々年の納税義務の判定

相続があった年が無事に終わっても、翌年(2年目)と翌々年(3年目)には、また少し違ったルールで判定を行います。

被相続人と相続人の売上高を合計して判定

相続があった年の翌年および翌々年については、被相続人の基準期間(前々年)の課税売上高と、相続人の基準期間の課税売上高を合計した金額が1,000万円を超えるかどうかで判定します。つまり、2人の過去の実績を足し合わせて、その合計額で事業の規模を判断することになります。この合計額が1,000万円を超えていれば、その1年間は消費税の課税事業者となります。

翌年以降に課税事業者になる具体例

それでは、相続の翌年にどうなるのかを具体的な数字で見てみましょう。被相続人と相続人のそれぞれに売上実績があるケースです。

項目 具体的な内容
被相続人の2年前の課税売上高 600万円
相続人の2年前の課税売上高 500万円
合計の課税売上高 1,100万円(1,000万円超)

それぞれの売上高は1,000万円以下ですが、2人の実績を合計すると1,100万円となり、1,000万円の基準を超えてしまいます。そのため、このケースでは相続の翌年の1月1日から12月31日までの1年間、消費税を納める義務が発生します。

相続財産が未分割の場合の消費税の判定方法

遺言書がなく、相続人同士の話し合い(遺産分割協議)が終わっていない状態のまま事業を引き継ぐこともあります。その場合の対応方法を解説します。

法定相続分に応じて売上高を按分します

相続財産が誰のものになるか決まっていない未分割の期間は、相続人全員が共同で事業を引き継いだものとして扱われます。この場合、消費税の判定に使う被相続人の売上高は、各相続人の法定相続分(法律で定められた相続割合)に応じて掛け算をして計算します。たとえば、被相続人の2年前の売上高が2,000万円で、配偶者の法定相続分が2分の1の場合、配偶者の判定用売上高は1,000万円となります。

遺産分割が後から完了した場合の取り扱い

年の途中で遺産分割協議がまとまり、特定の相続人が事業をすべて引き継ぐことになったとします。法律上、遺産分割の効果は亡くなった日にさかのぼりますが、消費税の納税義務の判定については、さかのぼって再計算を行う必要はありません。判定を行った時点での正しい事実関係に基づいていれば、そのまま法定相続分での判定を継続することが認められています

インボイス制度(適格請求書発行事業者)の手続き

令和5年10月からインボイス制度が始まり、事業を引き継ぐ際の手続きが一つ増えました。取引先に迷惑をかけないためにも、しっかりと確認しておきましょう。

インボイスの登録番号は引き継げません

被相続人がインボイスの登録を受けていた場合でも、その登録番号を相続人がそのまま引き継いで使い続けることはできません。インボイスの登録番号は、事業者一人ひとりに対して個別に与えられるものだからです。そのため、被相続人が亡くなったときは、速やかに税務署へ「適格請求書発行事業者の死亡届出書」を提出する必要があります。

みなし登録期間と税務署への届出期限

番号が引き継げないとなると、すぐにインボイスが発行できなくなり困ってしまいますよね。そこで、特例としてみなし登録期間という救済措置が用意されています。これは、相続が発生した日の翌日から最大で4ヶ月間は、被相続人の登録番号を一時的に使ってもよいというルールです。この期間内に、相続人ご自身が新しく「適格請求書発行事業者の登録申請書」を提出することで、スムーズにインボイスの発行を続けることができます。

まとめ

相続によって事業を引き継ぐと、悲しむ間もなくさまざまな手続きに追われてしまいます。とくに消費税については、ご自身の売上高だけでなく、亡くなった方の過去の実績も確認しなければならないため、判定がとても複雑です。基準期間の売上高が1,000万円を超えるかどうかをしっかりと計算し、申告漏れがないように注意しましょう。また、インボイス制度の登録申請など、期限が決められている届出も忘れずに行ってくださいね。

参考文献

国税庁 No.6602 相続で事業を引き継いだ場合の納税義務について

相続と消費税に関するよくある質問まとめ

Q. 相続した年の消費税は誰の売上高で判定しますか?

A. 亡くなった方(被相続人)の基準期間(前々年)の課税売上高が1,000万円を超えるかどうかのみで判定します。

Q. 相続した翌年の消費税の判定はどうなりますか?

A. 亡くなった方と事業を引き継いだ相続人の両方の基準期間の課税売上高を合計し、1,000万円を超えるかどうかで判定します。

Q. 遺産分割が終わっていない場合はどう計算しますか?

A. 各相続人が法定相続分に応じて、亡くなった方の過去の課税売上高を按分して消費税の納税義務を判定します。

Q. 亡くなった方のインボイス登録番号はそのまま使えますか?

A. インボイスの登録番号は引き継ぐことができません。相続人ご自身で新しく登録申請を行う必要があります。

Q. インボイスの再登録をするまでの間はどうすればいいですか?

A. 相続開始の翌日から最大4ヶ月間は「みなし登録期間」として、亡くなった方の番号を一時的に利用できる特例措置があります。

Q. 消費税の課税事業者になる場合、税務署への届出は必要ですか?

A. はい、速やかに「消費税課税事業者届出書」などを所轄の税務署へ提出する必要があります。

事務所概要
社名
税理士法人プライムパートナーズ
住所
〒107-0052
東京都港区赤坂5丁目2−33
IsaI AkasakA 17階
対応責任者
税理士 島本 雅史

本記事は正確な情報提供を心掛けておりますが、執筆時点の情報に基づいているため、法改正や人的ミス、個別のケースにより適用が異なる可能性があります。最新の情報や具体的なご相談については、お気軽に弊法人の税理士までお問い合わせください。

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