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確定申告 e-Tax|スマホでの手続きの流れと提出先を税理士が解説

目次
  1. e-Taxで確定申告する2つの方式
  2. マイナンバーカード方式とID・パスワード方式の違い
  3. マイナンバーカード方式で準備するもの
  4. ID・パスワード方式を使う場合
  5. 「e-Taxの番号」とは利用者識別番号のこと
  6. 確定申告書等作成コーナーからe-Tax送信までの流れ
  7. 作成開始から送信・保存までの手順
  8. マイナポータル連携で入力を減らす
  9. e-Tax確定申告の所要時間の目安
  10. スマホでe-Tax確定申告をするときのポイント
  11. 読取対応のスマホと推奨ブラウザ
  12. スマートフォンのマイナンバーカードを使う方法
  13. パソコンで作成してスマホで読み取る方法
  14. 確定申告の提出先税務署(納税地)
  15. 提出先は原則として住所地を所轄する税務署
  16. e-Taxでも作成画面で提出先税務署を設定する
  17. 海外勤務中に確定申告が必要になった場合
  18. e-Taxなら省略できる添付書類
  19. e-Taxの受付期間と申告期限
  20. 令和7年分の日程
  21. 送信後の受信通知と控えの保存
  22. 即時通知と受信通知で受付を確認する
  23. 申告書の控え(PDF)と入力データを保存する
  24. 納付がある場合の手続
  25. e-Tax確定申告でよくあるつまずき
  26. 電子証明書の有効期限切れ
  27. パスワードの入力ミスによるロック
  28. 同じ申告書を何度も送信してしまう
  29. 「利用者識別番号が廃止されています」と表示される
  30. 実務での取扱い例:期限直前に電子証明書が失効していたケース
  31. まとめ
  32. 参考文献
  33. 確定申告のe-Taxのよくある質問まとめ

「確定申告をe-Taxで出したいが、何を準備して、どの順番で進めればよいのか分からない」「提出先の税務署はどこになるのか」というご相談は、確定申告の時期になると毎年増えます。この記事は、個人事業主・不動産オーナー・副業のある会社員など、所得税の確定申告をe-Taxで提出したい個人の方に向けて、手続の流れと提出先、送信後の確認までを整理したものです。

結論から申し上げると、e-Taxでの確定申告は、マイナンバーカードと読取対応のスマホがあれば、国税庁の「確定申告書等作成コーナー」で作成から送信まで自宅で完結します。提出先は原則として住所地を所轄する税務署で、e-Taxでも作成画面で提出先税務署が設定されます。令和7年分の申告書の受付期間は令和8年2月16日から3月16日まででした。以下で、準備から送信後の控えの保存まで順にご説明します。

e-Taxで確定申告する2つの方式

e-Taxとは、所得税などの申告をインターネットを通じて行う仕組みです。確定申告書等作成コーナーからe-Taxで送信する方法には、「マイナンバーカード方式」と「ID・パスワード方式」の2つがあります。どちらで送信するかは、作成の最初の画面で選びます。

マイナンバーカード方式とID・パスワード方式の違い

国税庁のスマホ申告のマニュアルでも、作成の流れは「マイナンバーカード方式」を選んだ場合と「ID・パスワード方式」を選んだ場合に分けて案内されています国税庁 令和7年分のスマホ申告に関するマニュアル。主な違いは次のとおりです。

項目 マイナンバーカード方式 ID・パスワード方式
本人確認の方法 マイナンバーカードの電子証明書 e-TaxのID(利用者識別番号)と
パスワード
必要な機器 マイナンバーカード読取対応のスマホ
(パソコンの場合はICカードリーダライタも可)
マイナンバーカードの読み取りは不要
マイナポータル連携 利用できる 利用できない

これからe-Taxを始める方には、マイナポータル連携による自動入力も使えるマイナンバーカード方式が向いています。すでに税務署でID・パスワードの発行を受けている方は、ID・パスワード方式でも送信できます。

マイナンバーカード方式で準備するもの

マイナンバーカード方式でe-Tax送信をするために必要なものは、次の3つです国税庁 スマホとマイナンバーカードでe-Tax!。

  • スマホ、タブレットまたはパソコン(スマホで送信する場合はマイナンバーカード読取対応のスマホ。パソコン・タブレットの場合は読取対応のスマホかICカードリーダライタ)
  • マイナンバーカード
  • マイナンバーカード発行時にご自身で設定したパスワード2種類

パスワードは用途が分かれており、間違え続けるとロックがかかる回数も異なります。

利用者証明用電子証明書の
パスワード
数字4桁。e-Taxにログインする際に使う。3回連続で間違えるとロック
署名用電子証明書の
パスワード
英数字6~16文字。作成した申告等データを送信する際の電子署名に使う。5回連続で間違えるとロック

このほか、スマホでマイナンバーカードを読み取って送信するには、事前に「マイナアプリ」のインストールが必要とされています。申告の直前に慌てないよう、パスワードと機器の準備は早めに確認しておきましょう。

ID・パスワード方式を使う場合

マイナンバーカードを持っていない方は、e-TaxのID(利用者識別番号)とパスワードを入力してログインし、送信する方法があります。ID・パスワードの発行は税務署での手続になりますので、発行の流れは次の記事で詳しくご説明しています。

関連コラムe-TaxのID・パスワードはどこで発行?税務署での手続を税理士が解説▸

「e-Taxの番号」とは利用者識別番号のこと

「確定申告 e-Tax 番号」と検索される方の多くは、e-TaxのIDにあたる利用者識別番号を探しています。マイナンバーカード方式で初めてe-Taxを使う場合は、カードを読み取った後の画面で利用者登録を行い、すでに利用者識別番号をお持ちの方はその番号とパスワードを入力して進みます。番号の確認方法や取得の手順は、専用の記事をご覧ください。

関連コラム利用者識別番号とは|e-Taxの16桁番号の取得・確認方法▸

確定申告書等作成コーナーからe-Tax送信までの流れ

確定申告書等作成コーナーでは、画面の案内に沿って金額等を入力すると税額が自動計算され、作成した申告データをそのままe-Taxで送信できます。スマホ申告の流れは、国税庁のマニュアルで次の11の段階に整理されています。

作成開始から送信・保存までの手順

  1. 作成開始:作成する申告書等と年分、提出方法(e-Tax)を選択する
  2. マイナンバーカードの読み取り:利用者証明用電子証明書のパスワード(数字4桁)を入力し、カードをスマホにかざす
  3. 登録情報の確認:住所・氏名などの登録内容を確認し、変更があれば訂正する
  4. 申告する所得の選択等:その年に生じた所得を全て選ぶ
  5. 収入等の入力:選んだ所得ごとに金額を入力する
  6. 控除等の入力:適用する所得控除などを選んで入力する
  7. その他情報の入力:計算結果の確認からマイナンバーの入力まで進める
  8. 申告内容等の確認:送信前の申告書イメージで誤りがないか確認する
  9. 送信:画面の案内に沿って送信し、送信結果を確認する
  10. 申告書の控え(PDFファイル)の保存
  11. 入力データ(.data)の保存

事業所得・不動産所得・業務に係る雑所得があって青色申告決算書や収支内訳書を作る方は、最初の選択で「決算書・収支内訳書(+所得税)」を選びます。決算書を先に作成すると、その情報を引き継いで確定申告書を作成できます。

なお、送信の直前にもう一度マイナンバーカードの読み取りを求められることがあります。送信時の電子署名には署名用電子証明書のパスワード(英数字6~16文字)を使いますので、すぐ入力できるよう確認しておくと安心です。

マイナポータル連携で入力を減らす

マイナポータル連携とは、マイナポータル経由で給与所得の源泉徴収票や控除証明書等のデータを一括取得し、申告書の該当項目へ自動入力する機能です。所得税の確定申告では、マイナンバーカードを利用してe-Taxで確定申告書を提出する場合に限り、確定申告書等作成コーナーでこの機能を使えます国税庁 マイナポータル連携特設ページ。

給与所得の源泉徴収票の情報が自動入力されるには、勤務先が市区町村にeLTAXで給与支払報告書を提出していること等の要件があります。連携には事前準備が要りますので、初めて使う年は時間に余裕をもって設定しておきましょう。

e-Tax確定申告の所要時間の目安

e-Taxでの確定申告にかかる時間は、申告する所得の種類と、手元の資料がどれだけ揃っているかで大きく変わります。給与と医療費控除だけの方と、事業所得の決算書から作る方とでは、入力する項目の量がまったく違うためです。

実務で時間を左右しやすいのは、入力そのものよりも資料集めと、パスワード・電子証明書のトラブルです。前年に保存した入力データ(.data)を読み込むと、住所・氏名などの本人情報や還付金口座などの入力を省略できますので、毎年の申告ではデータを保存しておくことをおすすめします。

スマホでe-Tax確定申告をするときのポイント

スマホだけで申告書の作成から送信まで行う方が増えています。スマホ申告で押さえておきたい点をまとめます。

読取対応のスマホと推奨ブラウザ

スマホでe-Tax送信をするには、マイナンバーカード読取対応のスマホが必要です。国税庁のスマホ申告ガイドでは、推奨ブラウザ(AndroidはChrome、iPhone・iPadはSafari)以外は使わないよう案内されています。普段別のブラウザを使っている方は、作成コーナーを開く前に切り替えておきましょう。

スマートフォンのマイナンバーカードを使う方法

スマートフォンのマイナンバーカードを利用すると、実物のマイナンバーカードをスマホで読み取らなくても、申告書の作成・e-Tax送信ができます。Android端末ではすでに利用可能で、令和8年1月からはiPhoneでも「iPhoneのマイナンバーカード」を利用できるようになりました。利用者証明用電子証明書のパスワード(数字4桁)は、機種によってはスマホの生体認証機能で代えられます。

パソコンで作成してスマホで読み取る方法

入力はパソコンの大きな画面で行いたいという方は、パソコンで申告書を作成し、パソコン上に表示されたQRコードをスマホのアプリで読み取ることで、e-Taxによる申告ができます国税庁 【所得税及び復興特別所得税の申告等】。ICカードリーダライタを用意しなくても、読取対応のスマホがあれば送信できます。

確定申告の提出先税務署(納税地)

「e-Taxなら提出先は関係ないのでは」と思われがちですが、e-Taxで送信した申告書も、提出先の税務署が決まっています。送信前に、提出先が正しく設定されているかを確認しておきましょう。

提出先は原則として住所地を所轄する税務署

所得税の確定申告書は、提出時の納税地を所轄する税務署長に提出します。納税地は一般的には住所地で、国内に住所がない人は居所地が納税地になります。また、住所地のほかに事業所などがある人は、住所地等に代えて事業所などの所在地を納税地にすることができます国税庁 No.2029 確定申告書の提出先(納税地)。

ここでいう「提出時」がポイントです。年の途中や申告の前に引っ越した場合は、源泉徴収票に旧住所が書かれていても、申告書を提出する時点の住所地を所轄する税務署が提出先になります。

e-Taxでも作成画面で提出先税務署を設定する

確定申告書等作成コーナーでは、住所・氏名等の入力画面で郵便番号を入力すると、住所とあわせて申告書の提出先税務署が自動で表示されます。郵便番号で税務署を特定できない場合は、提出先税務署を選択します。

店舗や事務所の所在地で申告したい個人事業主の方は、「納税地の区分」で「事業所等」を選び、事業所等の所在地を入力します。自宅とは別の場所で事業をしている方は、どちらを納税地にするかを先に決めておきましょう。

海外勤務中に確定申告が必要になった場合

1年以上の予定で海外の支店などに転勤すると、出国後は一般的に所得税法上の非居住者となります。非居住者が確定申告書の提出や税金の納付・還付金の受け取りなどをする必要があるときは、納税管理人を定め、「所得税・消費税の納税管理人の選任・解任届出書」を非居住者の納税地を所轄する税務署長に提出する必要があります国税庁 No.1923 海外勤務と納税管理人の選任又は解任。

届出後、税務署が発送する書類は納税管理人あてに送られますが、確定申告書の提出先は納税管理人の住所地ではなく、非居住者本人の納税地を所轄する税務署です。日本の自宅を賃貸に出して海外へ赴任する場合などは、出国前に提出先と手続を担う人を決めておくことが大切です。

e-Taxなら省略できる添付書類

e-Taxで所得税の確定申告書を提出する場合、生命保険料控除の証明書などの第三者作成書類は、記載内容を入力して送信することで、税務署への提出または提示を省略できます国税庁 No.1904 給与所得者と電子申告。対象となる主な書類は次のとおりです。

  • 社会保険料控除の証明書
  • 小規模企業共済等掛金控除の証明書
  • 生命保険料控除の証明書・地震保険料控除の証明書
  • 寄附金控除の証明書
  • 医療費通知(医療費のお知らせ)
  • 住宅借入金等特別控除に係る借入金年末残高証明書(適用2年目以降のもの)

ただし、入力内容の確認のため、原則として法定申告期限から5年間は、税務署長等からこれらの書類の提示または提出を求められることがあります。求めに応じなかった場合は、添付または提示がなかったものとして扱われます。提出を省略した書類も、捨てずに5年間は保管しておきましょう。

e-Taxの受付期間と申告期限

所得税の確定申告は、毎年1月1日から12月31日までの1年間の所得と税額を計算して確定させる手続です。申告の期間は原則としてその年の翌年2月16日から3月15日まで、申告と納付の期限は原則として翌年3月15日です国税庁 No.2020 確定申告。

令和7年分の日程

直近に確認できる令和7年分の日程は次のとおりでした国税庁 所得税及び復興特別所得税の確定申告書は、スマホとマイナンバーカードを利用したe-Taxでの申告、キャッシュレス納付が便利です!。

確定申告書の受付期間 令和8年2月16日(月)から3月16日(月)まで
還付申告書 令和8年2月13日(金)以前でも提出できる
所得税及び復興特別所得税の
納期限
令和8年3月16日(月)
振替納税の振替日 令和8年4月23日(木)

令和8年分(令和9年に申告するもの)の日程は、国税庁から公表される案内で確認してください。e-Taxは、所得税の確定申告期間中は24時間提出が可能ですが、24時間提出できる期間は年によって異なるとされています。期限日の夜にトラブルが起きると立て直す時間がありませんので、期限の数日前には送信を終える計画にしておくと安心です。

送信後の受信通知と控えの保存

送信ボタンを押して終わりではなく、正しく受け付けられたかの確認と、控えの保存までが確定申告の手続と考えておきましょう。

即時通知と受信通知で受付を確認する

申告書が正常に送信されたかどうかは、e-Taxで申告書を送信した直後に表示される「即時通知」、またはメッセージボックスに格納される「受信通知」で確認できます国税庁 【申告書の提出】。送信できなかった場合には、画面上にエラー内容が表示されます。

受信通知の中身を開くには、マイナンバーカード等の電子証明書による認証が必要です。利用者識別番号を使ったログインでは、受信通知を開くことができない点にご注意ください。

申告書の控え(PDF)と入力データを保存する

送信後は「申告書等を表示する」から申告書等の控え(PDFファイル)を表示し、スマホやパソコンに保存します。あわせて入力データ(.data)を保存しておくと、翌年以降の申告書作成に利用できます。

控えの保存を忘れた場合でも、e-Taxで提出していれば、メッセージボックスの受信通知から申告書等のPDFファイルをダウンロードできます。なお、書面で提出する場合は、令和7年1月から申告書等の控えに収受日付印が押されなくなっています。融資の審査などで申告の控えを求められる方にとっては、受信通知が残るe-Taxのほうが提出の事実を確かめやすいといえます。

納付がある場合の手続

確定申告書を提出しても、税務署から納付書が送られてくることはありません。振替納税、ダイレクト納付、インターネットバンキング、クレジットカード、スマホアプリ、コンビニ、現金など、ご自身で選んだ方法で期限までに納付します。作成コーナーで最後に表示される納付金額の見方は、次の記事をご覧ください。

関連コラムe-Tax確定申告書等作成コーナーの最後に納付する金額とは|内訳と期限▸

e-Tax確定申告でよくあるつまずき

e-Taxの手続そのものは画面の案内に沿って進めれば難しくありませんが、毎年のように同じところでつまずく方がいらっしゃいます。

電子証明書の有効期限切れ

マイナンバーカードの有効期限とは別に、カードに入っている電子証明書の有効期限は、年齢にかかわらず発行から5回目の誕生日までです。有効期限を過ぎると、マイナンバーカードを利用したe-Taxによる申告手続はできませんので、お住まいの市区町村で更新手続をします。

申告期限の間際で更新が間に合わない場合は、作成方法を書面に変えて申告書を印刷し、提出するよう案内されています。カードの券面の有効期限だけを見て安心せず、電子証明書の期限も確認しておきましょう。

パスワードの入力ミスによるロック

利用者証明用電子証明書は3回、署名用電子証明書は5回連続で間違えるとロックがかかります。パスワードを忘れた場合やロックがかかった場合は、コンビニ等のキオスク端末で初期化・再設定ができます(どちらか一方がロックされた場合に限ります)。両方ともロックされた場合や電子証明書が失効している場合は、市区町村の窓口での手続になります。

同じ申告書を何度も送信してしまう

送信後に誤りに気づいて、申告期限内に訂正した申告書を送り直すことはできます。ただし、申告書を2回以上送信すると還付金の支払いが通常より遅くなる場合があるとされています。送信前の申告書イメージの確認を丁寧に行うことが、結局はいちばんの近道です。

「利用者識別番号が廃止されています」と表示される

以前取得した利用者識別番号でログインしようとしたときに、このような表示が出て先へ進めないことがあります。原因と税務署への確認の仕方は、次の記事で整理しています。

関連コラム利用者識別番号が廃止されていますと表示される原因と対処|税務署への確認方法▸

実務での取扱い例:期限直前に電子証明書が失効していたケース

ここでは、実務でよくある場面をもとにした設例をご紹介します。人物や日付は説明のためのものです。

自宅とは別の市で飲食店を営む個人事業主のAさんは、令和7年分の確定申告を毎年どおりスマホでe-Tax送信するつもりでした。3月12日に決算書と申告書の入力を終え、送信の手前でマイナンバーカードを読み取ったところ、電子証明書の有効期限切れのエラーが表示されました。電子証明書を発行したのが5年前で、その後5回目の誕生日を過ぎていたためです。

市区町村の窓口は確定申告の時期で混み合っており、期限の3月16日までに更新できるか分かりませんでした。そこでAさんは次の手順で対応しました。

  1. 入力したデータを.dataで保存したうえで、作成方法を書面提出に切り替えて申告書を印刷する(書面で出す場合は、マイナンバーの記載と本人確認書類の提示または写しの添付が必要になります)
  2. 納税地を店舗の所在地にしている場合は、提出先がその所轄税務署になっているかを確認する
  3. 申告書を郵便で送付し、期限内の通信日付印が押されるようにする(郵便または信書便で送付した場合は、通信日付印の日が提出日とみなされます)
  4. 納付は期限までにインターネットバンキングで済ませ、電子証明書の更新は申告後に行う

この例のように、期限直前のトラブルは「e-Taxにこだわらず、期限内に提出することを優先する」と判断するのが実務の基本です。一方で、書面に切り替えると添付書類の扱いや控えの残り方が変わるため、余裕のある時期に電子証明書の期限とパスワードを確かめておくことが何よりの対策になります。

e-Taxの手続は自分で進められる部分が多い一方、事業所と自宅のどちらを納税地にするか、海外赴任中の申告を誰が担うかなど、判断が必要な場面もあります。迷われたときは、まずは税理士にご相談ください。

まとめ

e-Taxでの確定申告は、マイナンバーカードと読取対応のスマホがあれば、確定申告書等作成コーナーで作成から送信まで自宅で完結します。提出先は提出時の納税地(原則は住所地)を所轄する税務署で、e-Taxでも作成画面で提出先税務署が設定されます。

  • 送信方法はマイナンバーカード方式とID・パスワード方式の2つ。マイナポータル連携はマイナンバーカード方式に限られる
  • マイナンバーカード方式では、パスワード2種類(数字4桁、英数字6~16文字)が必要
  • 提出先は提出時の納税地を所轄する税務署。事業所等の所在地を納税地にすることもできる
  • 海外勤務で非居住者になった場合は、納税管理人の届出が必要
  • 生命保険料控除の証明書などは入力・送信で提出を省略できるが、5年間は保管する
  • 令和7年分の受付期間は令和8年2月16日から3月16日まで
  • 送信後は受信通知で受付を確認し、控えのPDFと.dataを保存する
  • 電子証明書の有効期限は発行から5回目の誕生日まで。期限直前は書面提出への切替も検討する

e-Taxは一度準備を整えれば翌年以降の申告がぐっと楽になります。納税地の選び方や、事業所得・不動産所得を含む申告内容に不安がある場合は、まずは税理士にご相談ください。

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参考文献

確定申告のe-Taxのよくある質問まとめ

Q.e-Taxで確定申告するには何が必要ですか?

A.マイナンバーカード方式の場合は、マイナンバーカード、マイナンバーカード読取対応のスマホ(パソコンの場合は読取対応のスマホかICカードリーダライタ)、カード発行時に設定したパスワード2種類(数字4桁と英数字6~16文字)が必要です。

Q.e-Taxで送信した確定申告書の提出先はどこの税務署ですか?

A.提出時の納税地を所轄する税務署で、納税地は原則として住所地です。確定申告書等作成コーナーでは郵便番号を入力すると提出先税務署が自動で表示され、事業所等の所在地を納税地にする場合は「納税地の区分」で事業所等を選びます。

Q.スマホだけでe-Taxの確定申告はできますか?

A.マイナンバーカード読取対応のスマホとマイナンバーカードがあれば、確定申告書等作成コーナーで作成から送信までスマホで行えます。スマートフォンのマイナンバーカードを利用すれば、実物のカードを読み取らずに送信することもできます。

Q.e-Taxで送信できたかどうかはどう確認しますか?

A.送信直後に表示される「即時通知」か、メッセージボックスに格納される「受信通知」で確認できます。受信通知からは申告書等のPDFファイルもダウンロードできますが、開くにはマイナンバーカード等の電子証明書による認証が必要です。

Q.e-Taxで省略した添付書類は捨ててもよいですか?

A.捨てずに保管してください。入力内容の確認のため、原則として法定申告期限から5年間は、税務署長等から書類の提示または提出を求められることがあります。

Q.期限直前に電子証明書が失効していたらどうすればよいですか?

A.電子証明書の更新は市区町村の窓口で行います。申告期限の間際で更新が間に合わない場合は、作成方法を書面に変えて申告書を印刷し、郵送や持参で期限内に提出してください。

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対応責任者
税理士 島本 雅史

本記事は正確な情報提供を心掛けておりますが、執筆時点の情報に基づいているため、法改正や人的ミス、個別のケースにより適用が異なる可能性があります。最新の情報や具体的なご相談については、お気軽に弊法人の税理士までお問い合わせください。